幻想郷。
外の世界とは結界で隔離された、
人間や妖怪といった存在が住まう辺境の地。

ある日、博麗神社の巫女『博麗霊夢』は、
幻想郷の各地にそびえ立つ【謎の柱】を目にする。

その柱は『八雲紫』が主催する祭事、
互いの持つスペルカードを賭けて戦う
【符闘祭】の幕開けを告げる合図であった。

突如【符闘祭】を始めた『八雲紫』の真意を探るため、
『博麗霊夢』はスペルカード争奪戦に参加するのだった。